විමසීම්

ක්‍රොමැටින් සමඟ හිස්ටෝන් H2A සම්බන්ධ කිරීම ප්‍රවර්ධනය කිරීමෙන්, පොස්පරීකරණය අරාබිඩොප්සිස් හි ප්‍රධාන වර්ධන නියාමකය වන ඩෙල්ලා සක්‍රීය කරයි.

ඩෙලා ප්‍රෝටීන සංරක්ෂිත මාස්ටර් වේ.වර්ධන නියාමකයින්අභ්‍යන්තර සහ පාරිසරික ඉඟි වලට ප්‍රතිචාර වශයෙන් ශාක සංවර්ධනය පාලනය කිරීමේදී කේන්ද්‍රීය කාර්යභාරයක් ඉටු කරයි. DELLA පිටපත් කිරීමේ නියාමකයෙකු ලෙස ක්‍රියා කරන අතර එහි GRAS වසම හරහා පිටපත් කිරීමේ සාධක (TFs) සහ හිස්ටෝන් H2A වලට බන්ධනය වීමෙන් ඉලක්කගත ප්‍රවර්ධකයින් සඳහා බඳවා ගනු ලැබේ. මෑත කාලීන අධ්‍යයනයන් පෙන්වා දී ඇත්තේ DELLA ස්ථායිතාව යාන්ත්‍රණ දෙකක් හරහා පශ්චාත්-පරිවර්තන ලෙස නියාමනය කර ඇති බවයි: ෆයිටෝහෝමෝන් ගිබෙරෙලින් මගින් ප්‍රේරණය කරන ලද බහු-යුබික්විටිනේෂන්, එය එහි වේගවත් පිරිහීමට හේතු වන අතර, එහි සමුච්චය වැඩි කිරීම සඳහා කුඩා යුබික්විටින් වැනි විකරණකාරක (SUMO) සංයෝජනය කිරීම. ඊට අමතරව, DELLA ක්‍රියාකාරිත්වය විවිධ ග්ලයිකෝසයිලේෂන් දෙකකින් ගතිකව නියාමනය කරනු ලැබේ: DELLA-TF අන්තර්ක්‍රියාව O-fucosylation මගින් වැඩි දියුණු කරන නමුත් O-සම්බන්ධිත N-acetylglucosamine (O-GlcNAc) වෙනස් කිරීම මගින් නිෂේධනය කරනු ලැබේ. කෙසේ වෙතත්, DELLA පොස්පරීකරණයේ කාර්යභාරය අපැහැදිලිව පවතී, පෙර අධ්‍යයනයන් පරස්පර විරෝධී ප්‍රතිඵල පෙන්වා දී ඇති බැවින්, පොස්පරීකරණය DELLA පිරිහීම ප්‍රවර්ධනය කරන හෝ අඩු කරන බව පෙන්වන අයගේ සිට පොස්පරීකරණය එහි ස්ථායිතාවයට බලපාන්නේ නැති බව පෙන්වන අනෙක් අය දක්වා. මෙහිදී, අපි REPRESSOR හි පොස්පරීකරණ ස්ථාන හඳුනා ගනිමු.ගා1-3(RGA, AtDELLA) ස්කන්ධ වර්ණාවලීක්ෂමිතික විශ්ලේෂණය මගින් Arabidopsis thaliana වලින් පිරිසිදු කර ඇති අතර PolyS සහ PolyS/T කලාපවල RGA පෙප්ටයිඩ දෙකක පොස්පරීකරණය H2A බන්ධනය සහ වැඩිදියුණු කළ RGA ක්‍රියාකාරිත්වය ප්‍රවර්ධනය කරන බව පෙන්නුම් කරයි. ඉලක්ක ප්‍රවර්ධක සමඟ RGA සම්බන්ධ කිරීම. විශේෂයෙන්, පොස්පරීකරණය RGA-TF අන්තර්ක්‍රියා හෝ RGA ස්ථායිතාවයට බලපාන්නේ නැත. පොස්පරීකරණය DELLA ක්‍රියාකාරිත්වය ඇති කරන අණුක යාන්ත්‍රණය අපගේ අධ්‍යයනයෙන් හෙළි වේ.
DELLA ක්‍රියාකාරිත්වය නියාමනය කිරීමේදී පොස්පරීකරණයේ කාර්යභාරය පැහැදිලි කිරීම සඳහා, DELLA පොස්පරීකරණයේ ස්ථාන in vivo තුළ හඳුනා ගැනීම සහ ශාකවල ක්‍රියාකාරී විශ්ලේෂණ සිදු කිරීම ඉතා වැදගත් වේ. MS/MS විශ්ලේෂණයෙන් පසුව ශාක සාරය සම්බන්ධ කිරීමේ පිරිසිදු කිරීම මගින්, අපි RGA හි පොස්පරීකරණයේ පොස්පරීකරණය කිහිපයක් හඳුනා ගත්තෙමු. GA ඌනතාවයේ තත්වයන් යටතේ, RHA පොස්පරීකරණය වැඩි වේ, නමුත් පොස්පරීකරණය එහි ස්ථායිතාවයට බලපාන්නේ නැත. වැදගත් ලෙස, co-IP සහ ChIP-qPCR පරීක්ෂණ මගින් හෙළි වූයේ RGA හි PolyS/T කලාපයේ පොස්පරීකරණය H2A සමඟ එහි අන්තර්ක්‍රියාව සහ ඉලක්ක ප්‍රවර්ධකයන් සමඟ එහි සම්බන්ධතාවය ප්‍රවර්ධනය කරන බවත්, පොස්පරීකරණය RGA ක්‍රියාකාරිත්වය ඇති කරන යාන්ත්‍රණය හෙළි කරන බවත්ය.
LHR1 උපවසම TF සමඟ අන්තර්ක්‍රියා කිරීම හරහා ඉලක්කගත ක්‍රොමැටින් සඳහා RGA බඳවා ගනු ලබන අතර පසුව එහි PolyS/T කලාපය සහ PFYRE උපවසම හරහා H2A වෙත බන්ධනය වී RGA ස්ථාවර කිරීම සඳහා H2A-RGA-TF සංකීර්ණය සාදයි. හඳුනා නොගත් කයිනේස් එකක් මගින් DELLA වසම සහ GRAS වසම අතර PolyS/T කලාපයේ Pep 2 පොස්පරීකරණය RGA-H2A බන්ධනය වැඩි දියුණු කරයි. rgam2A විකෘති ප්‍රෝටීනය RGA පොස්පරීකරණය අහෝසි කරන අතර H2A බන්ධනයට බාධා කිරීම සඳහා වෙනස් ප්‍රෝටීන් අනුකූලතාවයක් අනුගමනය කරයි. මෙය අස්ථිර TF-rgam2A අන්තර්ක්‍රියා අස්ථාවර කිරීමට සහ ඉලක්කගත ක්‍රොමැටින් වලින් rgam2A විඝටනය වීමට හේතු වේ. මෙම රූපය RGA-මැදිහත් වූ පිටපත් කිරීමේ මර්දනය පමණක් නිරූපණය කරයි. H2A-RGA-TF සංකීර්ණය ඉලක්කගත ජාන පිටපත් කිරීම ප්‍රවර්ධනය කරන අතර rgam2A හි ඩිෆොස්ෆොරයිලීකරණය පිටපත් කිරීම අඩු කරන බව හැර, RGA-මැදිහත් වූ පිටපත් කිරීමේ සක්‍රිය කිරීම සඳහා සමාන රටාවක් විස්තර කළ හැකිය. Huang et al.21 වෙතින් රූපය වෙනස් කරන ලදී.
සියලුම ප්‍රමාණාත්මක දත්ත එක්සෙල් භාවිතයෙන් සංඛ්‍යානමය වශයෙන් විශ්ලේෂණය කරන ලද අතර, ශිෂ්‍යයාගේ t පරීක්ෂණය භාවිතයෙන් සැලකිය යුතු වෙනස්කම් තීරණය කරන ලදී. නියැදි ප්‍රමාණය මූලික වශයෙන් තීරණය කිරීම සඳහා සංඛ්‍යානමය ක්‍රම භාවිතා කර නොමැත. විශ්ලේෂණයෙන් කිසිදු දත්තයක් බැහැර කර නොමැත; අත්හදා බැලීම අහඹු ලෙස සිදු කර නොමැත; අත්හදා බැලීම අතරතුර දත්ත බෙදා හැරීම සහ ප්‍රතිඵල ඇගයීම පිළිබඳව පර්යේෂකයන් අන්ධ නොවීය. නියැදි ප්‍රමාණය රූප පුරාවෘත්තයේ සහ මූලාශ්‍ර දත්ත ගොනුවේ දක්වා ඇත.
අධ්‍යයන සැලසුම පිළිබඳ වැඩිදුර තොරතුරු සඳහා, මෙම ලිපිය හා සම්බන්ධ ස්වාභාවික කළඹ වාර්තා සාරාංශය බලන්න.
දත්ත කට්ටල හඳුනාගැනීමේ PXD046004 සමඟ PRIDE66 හවුල්කාර ගබඩාව හරහා ස්කන්ධ වර්ණාවලීක්ෂමිතික ප්‍රෝටියෝමික්ස් දත්ත ProteomeXchange සමුහයට දායක වී ඇත. මෙම අධ්‍යයනයේදී ලබාගත් අනෙකුත් සියලුම දත්ත අතිරේක තොරතුරු, අතිරේක දත්ත ගොනු සහ අමු දත්ත ගොනු වල ඉදිරිපත් කර ඇත. මෙම ලිපිය සඳහා මූලාශ්‍ර දත්ත සපයා ඇත.

 

පළ කිරීමේ කාලය: නොවැම්බර්-08-2024